宏基因组
1 技术简介
宏基因组测序是一种利用高通量测序技术完成样本中所有物种检测和功能分析的测序方法。宏基因组测序技术无需进行微生物的分离纯化培养，就能够快速有效地获得整个微生物群落的基因信息，可以更加深入地对群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等方面进行研究。
2 实验流程
3 样本准备
| 样本类型 | 土壤/污泥 | 粪便 | 血液 |
| 样本要求 | 1-5g | 1-5g | ≥2ml |
4 生信分析流程
5 分析结果展示（部分）
| 分析内容 | 解决问题 |
| 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据，保证数据质量 |
| 基因预测、注释 | 进行基因预测及相关性分析 |
| 物种、功能组成分析 | 物种、基因功能注释及相关分析 |
| 物种与功能差异分析 | 耐药相关基因相关分析 |
| CAG／MLG分析 | 疾病和菌株关联性研究 |
| CNV(copy number variation) | 菌株拷贝数变异与疾病关联研究 |
| 噬菌体 | 噬菌体及前噬菌体预测及分析 |
高分文章必备：
Metagenome-scale analysis yields insights into the structure and function of microbial communities in a copper bioleaching heap
Schematic diagram of nitrogen metabolism in the surface-layer mine tailings representing one important part of bioleaching system.
