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平台介绍

    开云平台网站官方拥有完善的测序平台,包括BGISEQ和illumina二代测序平台、nanopore和PacBio三代测序平台,满足不同的测序需求;同时搭建了大数据分析中心,与华为计算开展了大数据分析的深度合作,充足的计算资源为大数据的生信分析保驾护航。

   1 二代测序平台

    DNBSEQ-T7


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    Novaseq 6000

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    2 三代测序平台

    第三代测序技术是单分子测序技术,不需要经过PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序,主流阵营包括PacBio的SMRT和Oxford Nanopore Technologies纳米孔单分子测序技术。

    Nanopore平台

核心是利用纳米孔,孔内共价结合有分子接头,将纳米孔蛋白固定在电阻膜上后,再利用动力蛋白牵引核酸穿过纳米孔,通过实时监测并解码电流信号便可确定碱基序列,从而实现测序。具有长读长(最长Reads可达Mb级别),无GC偏好性,实时获得序列信息(最快可在1小时内完成测序流程及数据分析),通量高(单cell数据产量高达100G以上,直接检测碱基修饰信息等优势。



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    pacbio sequel  平台

PacBio专利的SMRT Cell含有15,0000个纳米级的零模式波导孔(zero-mode waveguides, ZMWs),每个ZMW都能够包含一个DNA聚合酶及一条DNA样品链进行单分子测序,并能够实时监测插入碱基的荧光信号。具有超长的测序读长(平均10-20kb,最长可超过30kb),无GC偏向性,高准确率(测序错误为完全随机错误,准确率可达到99.999%(QV50))、高敏感度(可检测到频率低于0.1%的突变),可直接检测修饰碱基等优势。



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    3 10X Genomics


     10x Genomics单细胞转录组测序,通过微流体芯片将单个细胞分配到单个油包水液滴中,进行反应。同时可以获得 1,000-10,000个细胞的表达信息,从而实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因表达差异的检测,是肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测以及胚胎发育研究的黄金方法。

 
    4 超算平台



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