1 技术简介
10x 单细胞ATAC-seq基于GemCode微流体平台,利用转座酶混合液孵育细胞核悬液,转座酶进入细胞核,优先在切割开放染色质区域使DNA片段化,并在DNA片段的末端添加测序引物;然后,带有标签的凝胶珠和单个细胞核包裹在油滴中,形成GEMs;随后凝胶珠溶解,细胞核裂解释放DNA片段,并在片段末端加上标签;GEMs破裂后,回收带有标签的DNA,构建文库;最后,利用二代测序平台对文库进行高通量测序。
2 技术流程
3 样品准备
样本准备 | |||
样本类型 | 组织 | 细胞 | 血液 |
样本要求 | ≥200mg | ≥10^6 | ≥2~3ml |
4 生物信息学分析流程
5 主要结果展示(只展示标准分析部分,具体项目具体分析,详细请咨询销售)
差异peak分析