《Cell》|单细胞+空间转录组绘制人类鳞状细胞癌组成和空间结构图谱
皮肤鳞状细胞癌(cSCC)主要特征是组织极性破坏和基底膜侵袭,是恶性肿瘤的一种。西米普利单抗/Cemiplimab是一款全人源PD-1抗体,用于转移性/局部晚期皮肤鳞状细胞癌的药物。但耐药和生物标志物预测反应的不足,需要更好地表征肿瘤微环境(TME)中的免疫抑制。单细胞转录组学(SC-RNA-Seq)揭示了许多癌症类型的肿瘤内异质性(ITH),确定了驱动耐药、预测转移风险和介导可塑性的细胞群,但研究往往缺乏识别肿瘤特异性生物学所需的正常组织比较和组织分离过程中空间信息的丢失。然而,空间转录组能够同时捕获TME内数十种细胞类型的位置,这对于理解肿瘤-基质串扰至关重要。本研究将单细胞转录组测序与空间转录组学和来自一系列人类cSCC和配对正常皮肤的多重离子束成像相结合,揭示了cSCC的空间异质性,突出了控制相关细胞类型定位和状态的潜在细胞间信号,并为进一步研究肿瘤和免疫动力学提供了资源。···